Las unidades navales son buques que exigen una mayor capacidad tecnológica, ya que contienen complejos sistemas electrónicos y de armamento. Las principales unidades construidas por SIMA son fragatas misileras de 2400 toneladas de desplazamiento, equipadas con misiles de largo alcance, y patrulleras de Guardacostas. Actualmente, estas embarcaciones conforman la flota de la Marina de Guerra del Perú y son una muestra del alto nivel tecnológico alcanzado por SIMA.
Dentro de las demandas de defensa y seguridad contra acciones ilícitas de contrabando, narcotráfico o terrorismo, SIMA desarrolla igualmente embarcaciones rápidas totalmente equipadas para diferentes condiciones geográficas, como lanchas costeras, cañoneras fluviales y lanchas rápidas de apoyo logístico.
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